根據(jù)介質(zhì)的不同，外泌體示蹤標記方法分為熒光染料、熒光蛋白、熒光素酶和物理標記法。

熒光蛋白是一種常用的報告蛋白，能在特定波長激發(fā)光作用下，發(fā)出相應的熒光信號。利用分子生物學方法將熒光蛋白與外泌體膜上的標記蛋白，如CD63、CD9、CD81等融合表達可以跟蹤外泌體從供體到受體細胞的軌跡。通過監(jiān)測膜蛋白的熒光，亦可實現(xiàn)活體培養(yǎng)物中外泌體轉(zhuǎn)移的可視化觀察。常用的熒光蛋白有綠色熒光蛋白GFP和紅色熒光蛋白RFP等。